Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUBP2Q9Y5Y2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUBP2Q9Y5Y2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUBP2Q9Y5Y2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUBP2Q9Y5Y2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUBP2Q9Y5Y2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms