Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN3Q9Y4C0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms