Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms