Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms