Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAK1Q9UPV9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms