Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS3Q9UNS2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS3Q9UNS2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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