Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX12Q9UMY4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms