Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms