Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP21Q9UK80 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP21Q9UK80 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms