Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED13Q9UHV7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms