Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFMBT1Q9UHJ3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms