Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPB1Q9UBR1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPB1Q9UBR1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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