Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms