Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23BQ9NYZ1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms