Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMLHEQ9NVH6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMLHEQ9NVH6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms