Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL1Q9NSC2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms