Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHST12Q9NRB3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHST12Q9NRB3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms