Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms