Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB9BQ9NP90 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms