Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARFGAP3Q9NP61 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms