Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KIAA1549Q9HCM3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms