Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMURF2Q9HAU4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms