Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MIXL1Q9H2W2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MIXL1Q9H2W2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms