Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms