Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms