Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FANCD2Q9BXW9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCD2Q9BXW9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms