Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM43Q9BTV4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms