Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms