Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTKNQ9BST9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms