Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NICN1Q9BSH3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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