Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEIS3Q99687 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEIS3Q99687 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms