Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VAT1Q99536 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms