Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ODF3Q96PU9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ODF3Q96PU9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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