Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BORCS6Q96GS4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BORCS6Q96GS4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms