Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms