Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C18orf8Q96DM3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms