Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC39Q96DD0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC39Q96DD0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms