Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF548Q8NEK5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms