Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SMIM20Q8N5G0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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