Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHC2Q8IXK0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHC2Q8IXK0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms