Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC117Q8IWD4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms