Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKAP1Q86WV1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms