Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF7IPQ6VMQ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms