Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms