Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD2Q6NTF9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD2Q6NTF9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms