Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms