Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDE2Q6IQ49 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms