Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms