Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms