Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHKAPQ2M3C7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
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